在幽灵行动荒野里面四个主角分别叫做midas和holt还有weaver和nomad，在正常情况下28岁左右就可以加入这个幽灵小队了，现在一共有两百名幽灵小队的成员其中四人一小队四队一组，会邀请在某些能力方面非常优秀的人物参加进组织。在荒野的四人小组里有两位以前就是来自各地行走的骑兵，还有一人原来是海豹队伍的剩下一人以前来自三角洲。
在游戏里我们要参与进这个神秘的幽灵小队中扮演代号为牧羊人的人物，和其他三位成员去往玻利维亚阻止毒品的蔓延，有意的去创造一些麻烦让走私队伍和当地政府的勾结败落。这个故事的背景开端发生在美国的大使馆里一位卧底干员行动失败，大使馆遭受到莫名的炸弹攻击导致较大量的伤亡，一些天过去了美国的军队方接到这名卧底的死亡照片，由此判断出这一次大使馆受到的攻击是对方有意而为，因此派出了这支小队和特工一起去那个国家完成任务。
我们需要在这个贩卖走私的组织内部进行调查然后消灭掉这个组织所有的敌人，组织由一位首领进行控制下分为四个部门，我们需要先从最底层的成员进行消灭然后一步步了解到更高层的领导所在位置，直到把这个部门的领导人消灭掉之后才算破坏完全。我们需要消灭掉两个以上部门的领导人才能够得知整个组织的领导人位置信息。
